Manuel de Matos Fernandes (Braga, 1953) licenciou-se em Engenharia Civil na Faculdade de Engenharia do Porto em 1976 e doutorou-se nesta escola em 1984, com uma tese elaborada no LNEC sobre modelos por elementos finitos aplicados a estruturas de suporte de terras. Após o doutoramento, foi responsável pelo desenvolvimento na FEUP de uma equipa de ensino e investigação na área da Geotecnia.
É Professor Catedrático desde 1999.
Foi Diretor do Departamento de Engenharia Civil e membro do Conselho Geral da Universidade do Porto.
Foi Investigador Responsável do Centro de Estudos da Construção, unidade de I&D com mais de 40 investigadores doutorados, que em 2014 deu origem ao CONSTRUCT, unidade que obteve a máxima classificação na última avaliação promovida pela Fundação para a Ciência e Tecnologia.
Recebeu em 2013 o Prémio de Excelência Pedagógica da FEUP.
É Presidente da Sociedade Portuguesa de Geotecnia e membro conselheiro da Ordem dos Engenheiros.