José de Assunção Gonçalves é licenciado em Medicina pela Faculdade de Ciências Médicas de Lisboa. Entre 2002 e 2012 foi Oficial Médico Naval da Armada Portuguesa. Em 2010 esteve destacado, como cirurgião geral, a bordo do navio hospital norte-americano USNS «Mercy» ao largo de Dili, durante a missão «Pacific Partnership». Participou na missão de Cooperação Técnico-Militar entre Portugal e Timor-Leste, como assessor das Falintil-FDTL, na edificação de um Serviço de Saúde da Componente Naval. Actualmente exerce a sua actividade clínica, como cirurgião geral, em Lisboa.